PippinHT — система препаративного электрофореза и пульс-электрофореза, позволяет разделять и выделять фрагменты нуклеиновых кислот и белков. Для разделения используются одна или две готовые кассеты по 12 ячеек, с различной концентрацией агарозы, что позволяет разделить один образец на несколько фракций, в каждой их которых содержатся молекулы нуклеиновых кислот или белков определённого размера.
Используются две готовые кассеты на 12 изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем определённой концентрации, которая выбирается пользователем в зависимости от величины выделяемого из образца фрагмента. В конце каждого капилляра имеется Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки. Для проведения электрофореза нуклеиновых кислот используется Трис-Taps буфер, для белков – SDS-буфер. Программное обеспечение определяет время элюирования на основе миграции ДНК-маркера.